液压喷射器控制系统主要由各种阀门组成。水压喷射器中，过去主要采用锥阀，现在大多采用插装阀。
过去的水压喷射器中，主要靠手柄及杠杆来开启锥阀，十分费力，后来都设置了具有力或功率放大作用的液压随动或机电随动系统，操作锥阀就比较轻便。而插装阀则完全由电液控制开关，轻便而灵活。
充液系统用于在充液行程中供给工作缸以低压液体，一般由充液罐、低压缓冲器、充液阀及管道组成，也是控制系统中的重要部分。